文章信息:
发表时间2024年12月14日
Q2/IF6.2
文章作者:
第一作者:何金花
核心速览
本研究分析了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)对猪肠道的毒性作用,并识别了与肠毒性相关的枢纽基因。
研究背景
文献综述指出DON是一种常见霉菌毒素,对多种细胞类型具有细胞毒性,并通过食物链对动物产品造成污染风险。研究探讨了DON对肠道的潜在有害影响,利用猪作为模型识别与肠毒性相关的枢纽基因,以填补知识空白并指导干预措施。研究难点包括识别和分析DON暴露后肠道组织中差异表达的基因,以及通过生物信息学技术构建蛋白质-蛋白质相互作用网络识别枢纽基因。
文章摘要:
脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)是一种常见于食物和动物饲料中的真菌毒素。食用后会对肠道造成有害影响。猪的消化系统在生理上与人类相似,因此猪是研究DON引起的肠毒性的合适模型。然而,DON在猪体内引起肠道损伤的确切机制仍需完全理解。
为了填补这一知识空白,本研究旨在确定与DON暴露相关的关键基因。本研究利用生物信息学技术对猪空肠组织在DON暴露下的转录组数据进行了广泛分析。共鉴定出265个差异表达基因(DEGs),其中238个上调表达,27个下调表达,表明DON暴露倾向于增加基因表达。进一步分析发现,上调表达的DEGs富集于肿瘤坏死因子、核因子κB、丝裂原活化蛋白激酶和Janus激酶/信号转导及转录激活相关信号通路。此外,还进行了加权基因共表达网络分析,以识别高度共表达模块。然后,将最高共表达模块中的基因与上调的DEGs进行交集,以构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,从而产生了237个重叠基因。随后,使用cytohubba与分子复合体检测相结合的方法,识别出在对DON的响应中起中心作用的6个枢纽基因(CXCR4、PTGS2、ICAM1、IL-1A、IL-1B和IL-10)。
总之,暴露于DON更有可能导致基因表达增加而不是减少。在识别出6个上调的与猪DON诱导的肠毒素性相关的免疫调节和炎症相关基因后,将其确定为枢纽基因。这项研究为阐明DON诱导的肠毒素性机制提供了新见解,并可为该条件的干预提供指导。
全文链接:
He J, Zhao G, Chen M, Ren X, Zhu P, Liu Z, Zhou J, Chen H, Xiao C, Li XG. Identification and functional analysis of hub genes involved in deoxynivalenol-induced enterotoxicity in porcine (Sus scrofa). Ecotoxicol Environ Saf. 2024 Dec 14;290:117544. doi: 10.1016/j.ecoenv.2024.117544. Epub ahead of print. PMID: 39675078.