新文章发表!Q3/IF3.1:Identification and validation of a novel glycolysis-related ceRNA network for sepsis-induced cardiomyopathy[2025/01/14]

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文章信息:
中心实验室科研团队发表
发表时间2024年2月

Q3/IF3.1

核心速览

       本研究识别并验证了一个与脓毒症相关心肌病(SIC)的新型糖酵解相关ceRNA网络,为SIC的早期诊断和治疗提供了新的潜在靶点。


研究发现
       本研究成功识别并验证了一个与糖酵解相关的ceRNA网络SNHG 17/miR-214-3p/IER 3,该网络可能在SIC的发生和发展中发挥关键作用。IER 3作为糖酵解相关的新靶点,在SIC中显著上调,而miR-214-3p和SNHG 17的表达模式与IER 3相反。


研究意义
       该发现对于深入理解SIC的病理生理机制具有重要意义,并为SIC的早期诊断和治疗提供了潜在的靶点。尽管存在样本量限制和临床验证的局限性,但该ceRNA网络在SIC诊断中的潜在价值仍值得进一步研究和验证。


文章摘要

目的:脓毒症诱导的心肌病(SIC)是危重症感染患者面临的主要致命状况。早期诊断和干预对于改善患者预后至关重要。鉴于糖酵解途径在 SIC 中的关键作用,本研究旨在建立一个与糖酵解相关的 ceRNA 网络,并探索新的诊断途径。

材料与方法:从 GEO 数据库中仔细筛选出与 SIC 相关的数据集。使用 CytoHubba 来识别与糖酵解相关的差异表达基因(DEGs)。随后采用预测方法构建 lncRNA-miRNA-mRNA 网络。双荧光素酶报告基因检测验证基因间的相互作用,并在 SIC 患者的外周血单个核细胞(PBMCs)中确认该 ceRNA 网络的特异性。采用逻辑回归分析来检验 ceRNA 网络与 SIC 之间的相关性。通过受试者工作特征(ROC)曲线评估诊断潜力,并通过相关性分析研究基因表达与临床指标之间的任何关联。

结果:IER3 被确定为 SIC 中与糖酵解相关的差异表达基因,且构建了一个 ceRNA 网络。通过预测建立了(SNHG17/miR-214-3p/IER3)网络。双的

荧光素酶报告基因检测证实了 IER3、miR-214-3p 和 SNHG17 之间存在相互结合。实时定量 PCR 验证了该 ceRNA 网络在 SIC 患者中的特异性表达。多变量逻辑回归分析建立了该 ceRNA 网络与 SIC 之间的相关性。ROC 分析表明其具有较高的诊断特异性(AUC > 0.8)。相关性分析显示 SIC 患者中 IER3 表达与氧合指数呈负相关(p < 0.05)。此外,miR-214-3p 表达与 NT-proBNP 呈负相关(p < 0.05)。

结论:本研究鉴定并验证了与 SIC 中糖酵解相关的 ceRNA 网络:SNHG17/miR-214-3p/IER3。该 ceRNA 网络可能在 SIC 的发病和发展中起关键作用。这一发现有助于进一步了解 SIC 的病理生理机制,并探索 SIC 的潜在诊断和治疗靶点。


全文链接
Cheng L, Liang J, Xie F, Han Z, Luo W, Chen H, He J. Identification and validation of a novel glycolysis-related ceRNA network for sepsis-induced cardiomyopathy. Front Med (Lausanne). 2024 Feb 19;11:1343281. doi: 10.3389/fmed.2024.1343281. PMID: 38439898; PMCID: PMC10910075.